170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4788 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 221 aa  433  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  71.35 
 
 		 187 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  64.13 
 
 		 186 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  64.17 
 
 		 187 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  60.87 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  60.33 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  62.57 
 
 		 186 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  58.05 
 
 		 186 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  56.9 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  58.05 
 
 		 186 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  57.47 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  56.32 
 
 		 186 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  55.43 
 
 		 191 aa  194  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  54.92 
 
 		 193 aa  188  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  55.68 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  51.11 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  48.57 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  49.17 
 
 		 193 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  58.23 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  49.14 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  48.89 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  50.58 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  51.88 
 
 		 180 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  47.4 
 
 		 186 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  47.4 
 
 		 186 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  43.27 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  41.57 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  42.61 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  50.68 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  40.46 
 
 		 190 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  48.99 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  45.35 
 
 		 187 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  48.34 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  47.3 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  47.3 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  46.71 
 
 		 211 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  44.87 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  44.74 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  47.68 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  47.95 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  34.66 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 185 aa  121  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  41.72 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  43.27 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  41.03 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 		 430 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  36.46 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 252 aa  104  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  35.59 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  44.19 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  42.96 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  40.25 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  38.51 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  31.74 
 
 		 176 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  43.42 
 
 		 199 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  38.46 
 
 		 481 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  34.69 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  38.82 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  36.08 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  37.58 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  28.82 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.24 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.85 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  33.96 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  39.68 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  33.89 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  32.16 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  32.16 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  33.09 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  32.75 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.82 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.9 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.52 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.96 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.76 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  40 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.76 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2656  NADPH-dependent FMN reductase  30.88 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.97 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.17 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  36.17 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.92 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>