More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3657 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
340 aa  694    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  70.88 
 
 
340 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  69.03 
 
 
340 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  57.52 
 
 
342 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  61.11 
 
 
348 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  60.53 
 
 
348 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  60.95 
 
 
344 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  57.94 
 
 
345 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  52.07 
 
 
352 aa  348  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  53.1 
 
 
353 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  53.67 
 
 
354 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  52.66 
 
 
347 aa  341  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  50.59 
 
 
356 aa  331  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  50.88 
 
 
355 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  52.34 
 
 
345 aa  326  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  51.61 
 
 
367 aa  323  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  51.18 
 
 
355 aa  322  8e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  48.67 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  43.53 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  45.72 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  47.21 
 
 
345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  46.43 
 
 
358 aa  301  8.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  49.84 
 
 
377 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  42.65 
 
 
347 aa  295  8e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  47.95 
 
 
344 aa  295  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  46.47 
 
 
363 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  45.13 
 
 
345 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  45.54 
 
 
367 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.27 
 
 
347 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.92 
 
 
345 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  44.28 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  44.12 
 
 
366 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  43.63 
 
 
364 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  43.24 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  43.24 
 
 
345 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  44.99 
 
 
349 aa  265  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  42.44 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  40.88 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  39.82 
 
 
351 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  41.07 
 
 
351 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  40.59 
 
 
351 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  41.07 
 
 
351 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  40.18 
 
 
352 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  40.5 
 
 
351 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  39.53 
 
 
351 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  44.06 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  44.41 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  44.41 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  39.23 
 
 
352 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  35.59 
 
 
345 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  34.55 
 
 
358 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  34.97 
 
 
377 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  31.75 
 
 
357 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  32.92 
 
 
374 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  36.73 
 
 
734 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  35.77 
 
 
359 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
369 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.47 
 
 
365 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  33 
 
 
374 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  30.99 
 
 
367 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  34.19 
 
 
361 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.74 
 
 
387 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  31.7 
 
 
352 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  30.43 
 
 
374 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  30.07 
 
 
371 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  28.26 
 
 
349 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  28.08 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  29.24 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  28.74 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.57 
 
 
366 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  29.53 
 
 
380 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 
410 aa  136  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  30.72 
 
 
372 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  28.66 
 
 
377 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  26.36 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  29.61 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  29.34 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.71 
 
 
396 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  29.18 
 
 
369 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  28.34 
 
 
481 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.66 
 
 
384 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.07 
 
 
381 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  28.85 
 
 
367 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  26.87 
 
 
374 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.8 
 
 
145 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.58 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  26.79 
 
 
376 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.83 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  32.09 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  28.51 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  24.42 
 
 
384 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  24.42 
 
 
384 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  29.33 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25.08 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.44 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  24.42 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.87 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>