More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2764 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  100 
 
 
377 aa  763    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  85.52 
 
 
367 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  63.58 
 
 
350 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  60 
 
 
345 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  58.88 
 
 
345 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  56.86 
 
 
363 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.79 
 
 
347 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.1 
 
 
345 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  56.3 
 
 
358 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  53.76 
 
 
366 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  55.33 
 
 
343 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  55.33 
 
 
345 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  55 
 
 
343 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  52.34 
 
 
352 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  53.5 
 
 
342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  54.05 
 
 
353 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  53.96 
 
 
354 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  52.29 
 
 
356 aa  318  7.999999999999999e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  45.67 
 
 
343 aa  318  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  50.15 
 
 
340 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  52.03 
 
 
347 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  54.33 
 
 
355 aa  316  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  53.96 
 
 
345 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  50.88 
 
 
355 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  45.43 
 
 
347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  46.04 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  47.66 
 
 
344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  52.24 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  52.41 
 
 
345 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  47.18 
 
 
340 aa  299  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  49.84 
 
 
340 aa  298  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  51.18 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  46.57 
 
 
364 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  48.55 
 
 
348 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  48.12 
 
 
348 aa  272  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  46.2 
 
 
349 aa  269  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  42.11 
 
 
330 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  39 
 
 
345 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  35.42 
 
 
351 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  35.12 
 
 
351 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  35.12 
 
 
352 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  35.21 
 
 
351 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  34.82 
 
 
351 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  35.12 
 
 
351 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  35.24 
 
 
351 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  35.24 
 
 
351 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  34.02 
 
 
351 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  35.12 
 
 
352 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  35.28 
 
 
353 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  35.28 
 
 
353 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  34.69 
 
 
358 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  34.76 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  34.15 
 
 
734 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  31.16 
 
 
378 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 
349 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  31.29 
 
 
357 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  29.55 
 
 
396 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  31.46 
 
 
359 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.36 
 
 
387 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.37 
 
 
145 aa  132  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  30.31 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  30.89 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  30.45 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.27 
 
 
366 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  28.45 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  27.6 
 
 
380 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  28.4 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  29.08 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  28.19 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  30.03 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  27.46 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  29.08 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  26.04 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  26.81 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 
410 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.03 
 
 
384 aa  113  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  28.4 
 
 
367 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.49 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  28.19 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
371 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  25.82 
 
 
365 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.92 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
386 aa  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  27.89 
 
 
367 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  29.73 
 
 
374 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.77 
 
 
362 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  28.9 
 
 
376 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  29.18 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.25 
 
 
331 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  29.03 
 
 
439 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  28.36 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  28.57 
 
 
402 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28.36 
 
 
439 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  28.01 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  27.51 
 
 
347 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>