More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11920 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 345 aa  685    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  77.46 
 
 		 358 aa  553  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  75.29 
 
 		 366 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  63.77 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  61.11 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  61.54 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  61.42 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  59.59 
 
 		 343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  59.17 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  58.88 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  56.1 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  54.71 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.79 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  51.02 
 
 		 356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  50.15 
 
 		 355 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  46.45 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  50 
 
 		 345 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  42.26 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  47.11 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  44.15 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  45.43 
 
 		 352 aa  288  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  48.83 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  43.92 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  44.64 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  46.38 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  46.26 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  46.13 
 
 		 367 aa  275  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  46.13 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  43.32 
 
 		 340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  44.12 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  39.94 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  43.64 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  43.64 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  44.31 
 
 		 349 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  45.13 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  40.9 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  44.18 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  38.94 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  34.82 
 
 		 351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  34.52 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  34.52 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  34.82 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  34.82 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  34.02 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  34.23 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  34.23 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  34.23 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  35.12 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  35.82 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  35.82 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  39.47 
 
 		 734 aa  165  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.77 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  33.63 
 
 		 358 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  37.17 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  36.17 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  36.56 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  33.53 
 
 		 352 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  34.2 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  32.94 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.1 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  35.17 
 
 		 361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  31.76 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  32.15 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  34.63 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.26 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  30.97 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.53 
 
 		 145 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  30.38 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.21 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  32.09 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  30.68 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  31.47 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  31.86 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  31.69 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  32.35 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  30.97 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  30.09 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.58 
 
 		 381 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  31.47 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  32.65 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  30.09 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  28.86 
 
 		 410 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  34.9 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  32.35 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.79 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  31.55 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  29.67 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  30.31 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  30.51 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  30.82 
 
 		 439 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  39.42 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  31.17 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  36.69 
 
 		 383 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  28.96 
 
 		 436 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  28.96 
 
 		 436 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  28.96 
 
 		 436 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  27.02 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>