More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1404 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 
145 aa  298  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  65.15 
 
 
347 aa  182  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  50.75 
 
 
364 aa  149  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  56.82 
 
 
345 aa  148  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  51.94 
 
 
356 aa  147  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
345 aa  145  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  49.64 
 
 
345 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  48.89 
 
 
366 aa  144  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  50.76 
 
 
350 aa  144  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  50 
 
 
352 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  50.37 
 
 
377 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.53 
 
 
345 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.45 
 
 
347 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  56.72 
 
 
355 aa  141  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  48.25 
 
 
363 aa  140  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  49.63 
 
 
367 aa  140  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  52.55 
 
 
353 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  53.28 
 
 
354 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  46.04 
 
 
345 aa  137  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  54.48 
 
 
355 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  47.01 
 
 
344 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  49.28 
 
 
345 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  46.04 
 
 
343 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  47.55 
 
 
330 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  45.32 
 
 
343 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  46.21 
 
 
358 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  48.48 
 
 
340 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  47.45 
 
 
343 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  53.79 
 
 
347 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  55.64 
 
 
367 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
349 aa  130  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  44.03 
 
 
342 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  43.8 
 
 
340 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  43.08 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 
344 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  41.04 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  46.97 
 
 
345 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 
348 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  43.7 
 
 
345 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  40.3 
 
 
351 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  40.3 
 
 
351 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  40.3 
 
 
351 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  40.3 
 
 
352 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  41.04 
 
 
351 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  39.55 
 
 
351 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  38.81 
 
 
351 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  48.48 
 
 
348 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  38.81 
 
 
351 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.86 
 
 
387 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  41.54 
 
 
353 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  41.54 
 
 
353 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  38.06 
 
 
352 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  34.33 
 
 
374 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  34.59 
 
 
382 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.71 
 
 
366 aa  94  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  35.71 
 
 
371 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  35.71 
 
 
388 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  34.96 
 
 
378 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  34.38 
 
 
365 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  34.65 
 
 
410 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  33.83 
 
 
367 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  33.57 
 
 
380 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  34.68 
 
 
358 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  36.97 
 
 
377 aa  87  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  36.61 
 
 
349 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  32.33 
 
 
374 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  36.13 
 
 
734 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  37.27 
 
 
359 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.79 
 
 
365 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  30.83 
 
 
369 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.89 
 
 
381 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  33.8 
 
 
396 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  34.13 
 
 
377 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  35.85 
 
 
357 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  35.83 
 
 
376 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  35.64 
 
 
374 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  34.13 
 
 
352 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.28 
 
 
396 aa  80.9  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.01 
 
 
384 aa  80.9  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  34.38 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  33.83 
 
 
371 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  33.1 
 
 
367 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  34.92 
 
 
372 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  33.33 
 
 
481 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 
386 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  34.92 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  30.99 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  33.33 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  32.41 
 
 
345 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  28.69 
 
 
344 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  38.06 
 
 
376 aa  67.4  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.62 
 
 
342 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  32.41 
 
 
347 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.93 
 
 
344 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  32.41 
 
 
347 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  34.26 
 
 
355 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  32.41 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  32.41 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  32.41 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>