More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3644 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  100 
 
 		 346 aa  722    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  88.12 
 
 		 345 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  87.25 
 
 		 345 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  88.44 
 
 		 347 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  98.27 
 
 		 346 aa  712    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  94.81 
 
 		 347 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  99.71 
 
 		 346 aa  720    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  86.71 
 
 		 347 aa  628  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  76.88 
 
 		 355 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  52.31 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  51.16 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  49.57 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  49.13 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  48.55 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  48.27 
 
 		 345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  44.96 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  45.53 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  45.09 
 
 		 343 aa  322  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  44.96 
 
 		 363 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  44.8 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  43.23 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.71 
 
 		 353 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.65 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  26.04 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.35 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.01 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  28.29 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.46 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.16 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  27.56 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  26.38 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.44 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.78 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  36.6 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  36.6 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  26.45 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.01 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  24.06 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.87 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.66 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  29.92 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  34.18 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  27.56 
 
 		 364 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.61 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  27.43 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  24.61 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.25 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  26.35 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  24.29 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  27.78 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  25.53 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  28.41 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.04 
 
 		 346 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  26.4 
 
 		 402 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  24.24 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  27.46 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.53 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.44 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24.84 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  28.1 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  26.48 
 
 		 384 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  28.1 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  28.1 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  25.2 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  24.29 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  27.44 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  27.49 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  27.16 
 
 		 4483 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.2 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  25.29 
 
 		 734 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  25.94 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  27.27 
 
 		 439 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  25.21 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  28 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  24.79 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  26.2 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  26.73 
 
 		 376 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  24.86 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  32.22 
 
 		 321 aa  89.7  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.15 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 321 aa  89.4  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  28.09 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  23.3 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.01 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  25.63 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  25.63 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  23.93 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.93 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  25.6 
 
 		 355 aa  86.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  22.87 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  24.86 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  26.45 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  29.79 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  27.03 
 
 		 6889 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  25.73 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>