More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3794 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
374 aa  755    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  73.79 
 
 
357 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  75 
 
 
361 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  69.92 
 
 
359 aa  501  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  53.87 
 
 
352 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  54.49 
 
 
349 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  46.93 
 
 
377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  46.72 
 
 
734 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.9 
 
 
365 aa  292  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  38.22 
 
 
369 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  38.26 
 
 
374 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  38.27 
 
 
371 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  40.75 
 
 
396 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  37.18 
 
 
380 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  36.71 
 
 
367 aa  206  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.73 
 
 
387 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  36.13 
 
 
365 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  37.86 
 
 
382 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  37.05 
 
 
378 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  35.75 
 
 
376 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  38.76 
 
 
481 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  36.41 
 
 
371 aa  195  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.62 
 
 
366 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  36.42 
 
 
372 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  35.31 
 
 
367 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  34.36 
 
 
374 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  35.29 
 
 
369 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.78 
 
 
381 aa  189  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  33.62 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 
410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 
386 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.85 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  33.72 
 
 
351 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  34.64 
 
 
374 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
351 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  33.43 
 
 
351 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  33.43 
 
 
351 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  35 
 
 
356 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.26 
 
 
384 aa  176  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  33.04 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  33.04 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  32.74 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  34.36 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  30.99 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  30.99 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  33.95 
 
 
377 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  32.75 
 
 
351 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  32.75 
 
 
351 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  33.7 
 
 
376 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  36.42 
 
 
367 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  34.02 
 
 
352 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  32.92 
 
 
340 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  30.4 
 
 
343 aa  160  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  33.02 
 
 
340 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  33.95 
 
 
330 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  34.34 
 
 
345 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  35.24 
 
 
355 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  31.94 
 
 
342 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.56 
 
 
345 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  34.17 
 
 
343 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  33.43 
 
 
344 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  30.98 
 
 
345 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  34.8 
 
 
343 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  34.48 
 
 
345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  31.2 
 
 
345 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  32.92 
 
 
345 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  33.82 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.29 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  33.84 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  32.56 
 
 
358 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  29.6 
 
 
345 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  29.94 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  31.05 
 
 
348 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 
348 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  29.15 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.15 
 
 
347 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  30.89 
 
 
377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  31.95 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 
353 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  34.23 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  32.91 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  29.91 
 
 
347 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
344 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  26.88 
 
 
347 aa  116  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  40.11 
 
 
330 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  27.38 
 
 
384 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 
328 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  33.8 
 
 
352 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.76 
 
 
331 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  27.04 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  27.04 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  23.62 
 
 
421 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  26.85 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.02 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.81 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  32.43 
 
 
334 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>