More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1675 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  100 
 
 		 348 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  97.13 
 
 		 348 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  85.34 
 
 		 344 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  66.86 
 
 		 345 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  62.76 
 
 		 340 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  60.53 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  59.12 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  56.89 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  53.6 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  53.31 
 
 		 353 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  52.75 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  54.84 
 
 		 355 aa  335  9e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  52.31 
 
 		 356 aa  332  4e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  54.62 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  55.07 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  52.89 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  51.45 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  48.55 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  47.69 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  48.1 
 
 		 367 aa  298  8e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  44.51 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  47.54 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  41.79 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  46.9 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  45.53 
 
 		 344 aa  289  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  41.62 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  48.13 
 
 		 343 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.93 
 
 		 347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  45.8 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  48.12 
 
 		 363 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  46.67 
 
 		 343 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  46.38 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  45.43 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.77 
 
 		 345 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  45.11 
 
 		 366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  45.04 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  38.9 
 
 		 351 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  38.62 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  38.62 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  38.62 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  38.04 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  38.33 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  38.04 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  38.04 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  38.04 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  44.51 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  37.75 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  36.78 
 
 		 353 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  36.78 
 
 		 353 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  38.15 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  35.06 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  34.57 
 
 		 734 aa  169  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.34 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  31.05 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.28 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  30.57 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  31.05 
 
 		 374 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  30.55 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  31.61 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  32.28 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  31.7 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  30.75 
 
 		 378 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  31.03 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.61 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  30.55 
 
 		 374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  32.76 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  30.46 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  30.88 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  30.42 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  29.8 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  31.41 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  29.77 
 
 		 377 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  31.21 
 
 		 386 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.32 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  29.02 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  31.32 
 
 		 369 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  31.41 
 
 		 371 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  29.77 
 
 		 376 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  30.65 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  32.16 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.46 
 
 		 384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  29.89 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.67 
 
 		 396 aa  125  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  48.48 
 
 		 145 aa  122  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  28.45 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  32.11 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  29.69 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.95 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  24.29 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  29.2 
 
 		 6889 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  28.18 
 
 		 3337 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  29.48 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  28.12 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  28.02 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.48 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>