More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2104 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  100 
 
 		 353 aa  736    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  57.39 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  34.63 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30.62 
 
 		 362 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  38.65 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  33.13 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  32.14 
 
 		 347 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.14 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.49 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  30.71 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  31.25 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  30.98 
 
 		 346 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  29.15 
 
 		 362 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  30.35 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  39.19 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  28.66 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  30.85 
 
 		 345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  31.44 
 
 		 345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.82 
 
 		 371 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  30.87 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  30.28 
 
 		 333 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  32.2 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  30.83 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  31.44 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.33 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  35.98 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  31.8 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  36.95 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.46 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.86 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.7 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  28.45 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  27.87 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  28.25 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  27.9 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.44 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  30.22 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  31.85 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  28.78 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  27.35 
 
 		 362 aa  126  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  27.35 
 
 		 362 aa  126  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  30.18 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 		 346 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  35.03 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  26.97 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.28 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  26.59 
 
 		 348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  28.65 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  35.38 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  35.6 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  26.52 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  26.39 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  32.14 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.92 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.24 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  26.44 
 
 		 734 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  29.52 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  31.13 
 
 		 356 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  35.23 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  26.72 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  30.21 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  26.82 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  26.2 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  30.57 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  32.14 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  32.14 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  32.14 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  31.14 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  31.94 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  34.43 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  25.49 
 
 		 388 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  31.94 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  31.5 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  26.7 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  29.18 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  32.14 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  31.91 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  28.44 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  35.05 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  29.79 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  29.28 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  27.67 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  36.16 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.45 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  27.11 
 
 		 3337 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  32.48 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.85 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  25.35 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  34.94 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  35.67 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  32.19 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  33.33 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>