More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  83.11 
 
 		 380 aa  653    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 381 aa  781    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  83.81 
 
 		 371 aa  627  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  81.69 
 
 		 374 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  82.92 
 
 		 369 aa  614  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  81.72 
 
 		 366 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  82.34 
 
 		 372 aa  611  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  77.9 
 
 		 369 aa  609  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  79.94 
 
 		 365 aa  607  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  81.07 
 
 		 374 aa  604  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  75.33 
 
 		 387 aa  598  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  80.21 
 
 		 376 aa  591  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  77.68 
 
 		 374 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  80.17 
 
 		 382 aa  591  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  80.61 
 
 		 371 aa  590  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  79.95 
 
 		 367 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  76.65 
 
 		 376 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  78.96 
 
 		 388 aa  578  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  74.07 
 
 		 410 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  74.73 
 
 		 377 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  73.89 
 
 		 386 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  73.39 
 
 		 396 aa  548  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  70.42 
 
 		 378 aa  544  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  73.05 
 
 		 384 aa  542  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  71.43 
 
 		 367 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  77.95 
 
 		 481 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  67.14 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  38.44 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  39.3 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  38.42 
 
 		 734 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  38.44 
 
 		 357 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  36.6 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  34.36 
 
 		 352 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.56 
 
 		 365 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  34.47 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  30.99 
 
 		 351 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  30.41 
 
 		 352 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  30.12 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  29.79 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  29.82 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  29.82 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  35.2 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  30.12 
 
 		 351 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  34.21 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  30.99 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  29.15 
 
 		 353 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  29.15 
 
 		 353 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  32.36 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  32.17 
 
 		 330 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  31.92 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.17 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  31.34 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  31.37 
 
 		 366 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  31.59 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  30.86 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.58 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  26.45 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  31.21 
 
 		 345 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  30.88 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  30.62 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  29.07 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  28.9 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  29.71 
 
 		 354 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  31.32 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  29.97 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  28.82 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  29.5 
 
 		 342 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.83 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  30.66 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  30.59 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  28.99 
 
 		 340 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  28.49 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  28.08 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  29.77 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  27.11 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  28.94 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  27.46 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  28.82 
 
 		 363 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.89 
 
 		 145 aa  90.1  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.52 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.47 
 
 		 328 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  22.56 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  23.98 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  28.68 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.63 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  24.86 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  30.04 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.15 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.03 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  26.02 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>