More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4140 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  100 
 
 		 354 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  38.27 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  34.23 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.29 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.53 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.07 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.64 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  31.74 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  29.45 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.52 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  27.35 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.28 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.92 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  24.41 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  27.93 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  27.93 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  30.99 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  28.24 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.37 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.16 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.97 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  36.63 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  28.53 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  27.06 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.52 
 
 		 352 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.69 
 
 		 402 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  27.94 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.86 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  33.03 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  36.22 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  36.63 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.88 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  27.43 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  25.88 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.91 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  28.43 
 
 		 333 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  40 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  35.75 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  36.05 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  25.14 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  34.97 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  28.16 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  24.52 
 
 		 439 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.48 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  27.33 
 
 		 383 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.48 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  24.72 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.86 
 
 		 328 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  27.84 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  25.07 
 
 		 436 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  25.07 
 
 		 436 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  34.98 
 
 		 327 aa  96.3  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  25.07 
 
 		 436 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  34.3 
 
 		 282 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  34.3 
 
 		 282 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  34.3 
 
 		 282 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  34.36 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  30.37 
 
 		 387 aa  92.8  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  26.7 
 
 		 342 aa  92.8  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  35.47 
 
 		 286 aa  92.8  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  34.43 
 
 		 355 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  29.14 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  34.78 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  35.67 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  26.32 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  30.45 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  31.44 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  33.88 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  27.83 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  27.04 
 
 		 734 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  27.83 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  27.83 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  25.82 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.53 
 
 		 329 aa  90.1  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.15 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  27.66 
 
 		 353 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  33.88 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.16 
 
 		 293 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  26.65 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  26.54 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  27.13 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  29.68 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.8 
 
 		 314 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  27.98 
 
 		 310 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  33.33 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.12 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  23.87 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  24.78 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.61 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>