More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3874 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  71.89 
 
 		 290 aa  417  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  71.58 
 
 		 282 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  71.58 
 
 		 282 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  72.76 
 
 		 282 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  71.58 
 
 		 282 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  71.22 
 
 		 301 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2903  putative F420-dependent oxidoreductase  70.04 
 
 		 285 aa  367  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.795057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  59.79 
 
 		 281 aa  349  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  44.24 
 
 		 274 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  42.51 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  41 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  43.26 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  39.71 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.07 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  39.86 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  40.64 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  41.29 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12191  hypothetical protein  40.46 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.69283e-42  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  38.01 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  38.02 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  37.26 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  35.74 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4930  luciferase-like protein  38.61 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  32.05 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  29.85 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  28.77 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.06 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.6 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  33.78 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  36.75 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  30.83 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  35.47 
 
 		 354 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.91 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  29.6 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  29.86 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  32.97 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  40.13 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 		 307 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  30.53 
 
 		 324 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.03 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  31.73 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  27.98 
 
 		 337 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  33.7 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  28.68 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  28.89 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  32.14 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  28.7 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  29.37 
 
 		 339 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.88 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  34.55 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  34.55 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  28.89 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.26 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  34.55 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  32.62 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  31.31 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  29.96 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  31.35 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  26.1 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  33.18 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.39 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.34 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  35.5 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  29.47 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  34.93 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  36.88 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  30.56 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.14 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  33.15 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  32.73 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.77 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  28.87 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  30 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  29.63 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  28.17 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  30.59 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  30.59 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  32.24 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.72 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  33.52 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  32.98 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  28.5 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  30.33 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  28.5 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  28.33 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  29.09 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  28.99 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  28.99 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  34.78 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  28.99 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  27.7 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  30 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>