More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5219 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 
304 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.95 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  35.07 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  33.86 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  32.41 
 
 
304 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  34.57 
 
 
339 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  34.2 
 
 
272 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  29.87 
 
 
285 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  35 
 
 
307 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  30.64 
 
 
291 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  30.64 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  30.64 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  33.49 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  32.38 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.36 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  33.33 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  34 
 
 
290 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.22 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.22 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  32.98 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.22 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  30.37 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  32.16 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  28.81 
 
 
289 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  34.58 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  36.57 
 
 
316 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  35.36 
 
 
327 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.86 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  27.64 
 
 
337 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.5 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  34.55 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  32.74 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  32.74 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  32.74 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  36.11 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  33.53 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  35.2 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.32 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  33.49 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.4 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.62 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  29.95 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  31.43 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  31.52 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  31.56 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  27.9 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  30.87 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  34.34 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2017  Luciferase-like monooxygenase  27.05 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00175263  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  29.89 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2531  luciferase-like protein  36.62 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  28.84 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  31.22 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  30.28 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.07 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  29.39 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  32.23 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.43 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  33.91 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.94 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  28.85 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  31.31 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  28.95 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  33.33 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2903  putative F420-dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.795057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  30.97 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  31.75 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  27.59 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  30.37 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  29.52 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  28.96 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  27.59 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  27.59 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  35.18 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  29.1 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  32.21 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12191  hypothetical protein  30.94 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.69283e-42  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  38.51 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  38.51 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  37.84 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.12 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  28.37 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  29 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  31.34 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  34.19 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
754 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  32.1 
 
 
355 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.17 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  31.76 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  34.67 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  30.53 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  24.83 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  30 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  29.66 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>