More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4576 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  100 
 
 		 355 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  61.1 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  59.43 
 
 		 344 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  60.68 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  57.59 
 
 		 346 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  61.38 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  58.79 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  58.5 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  58.38 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  58.67 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  58.38 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  58.5 
 
 		 349 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  61.27 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  52.48 
 
 		 349 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  52.48 
 
 		 349 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  51.71 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  53.17 
 
 		 342 aa  305  7e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  47.71 
 
 		 342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.85 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  47.14 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  47.45 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  44.98 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  44.98 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  44.68 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.59 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.48 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  43.55 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  47.56 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  43.2 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  39.88 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  43.77 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  40.61 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  39.88 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  40.84 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  40.61 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  40.61 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  39.39 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  43.21 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  45.72 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  42.42 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  42.12 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  43.36 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  39.94 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  40.84 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  40.88 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  41.82 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  38.11 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  42.22 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.47 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.01 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.9 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  28.12 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.65 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  34.24 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.52 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.1 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  32.62 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.97 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  28.43 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  31.8 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  41.98 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.19 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.25 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.48 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.66 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.66 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.66 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.43 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  27.3 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  27.3 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  29.05 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  26.3 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  26.58 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  27.3 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.07 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  34 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  36.76 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  36.65 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  33.75 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.16 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.27 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  34 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  33.77 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.78 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  34.62 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  33.57 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.38 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.66 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  30 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 		 764 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.1 
 
 		 304 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  27.64 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  34.16 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.33 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  26.76 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  26.76 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  26.76 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>