More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3948 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
345 aa  705    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  60.37 
 
 
333 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.7 
 
 
328 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.97 
 
 
318 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.75 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.17 
 
 
333 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.79 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.79 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.38 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.55 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.69 
 
 
323 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.75 
 
 
335 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.44 
 
 
320 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.17 
 
 
327 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.5 
 
 
344 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  27.42 
 
 
321 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  29.77 
 
 
317 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.3 
 
 
328 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.27 
 
 
320 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.27 
 
 
320 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  27.06 
 
 
346 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.22 
 
 
318 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.77 
 
 
328 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  22.56 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  26.25 
 
 
345 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.68 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.03 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.65 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.99 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  25.81 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  25.81 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.93 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.16 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  25.88 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  28.04 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.58 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.46 
 
 
337 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  25 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  26.45 
 
 
383 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  25.16 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  26.35 
 
 
350 aa  86.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  28.91 
 
 
323 aa  85.9  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.22 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  26.69 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.48 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.15 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  28.04 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.93 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  25.83 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  25.83 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.83 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 
289 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  25.36 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  25.72 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  26.01 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  26.01 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  26.01 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  29.32 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  25.8 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  25.8 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  24.41 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  26.52 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  22.29 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  23.24 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.36 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.76 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  23.84 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  24.54 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  24.17 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  31.22 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  27.67 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  25.23 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  26.48 
 
 
357 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  26.97 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  27.22 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  26.52 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  26.52 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.59 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  26.16 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  24.41 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  25.42 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  29.11 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.89 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  25.63 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  22.29 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  25.78 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  27.11 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  25.6 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  26.47 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  27.21 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.84 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.69 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  29.56 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  26.22 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>