More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4412 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  100 
 
 
317 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  52.38 
 
 
321 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.63 
 
 
318 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.28 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.78 
 
 
333 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.68 
 
 
344 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.2 
 
 
328 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.67 
 
 
337 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.77 
 
 
345 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  33.83 
 
 
323 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.1 
 
 
335 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  40.12 
 
 
325 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.88 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.07 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.01 
 
 
336 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.5 
 
 
349 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.34 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  29.79 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.72 
 
 
336 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.37 
 
 
320 aa  86.3  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.41 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.68 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  22.34 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.96 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.52 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  32.23 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  32.55 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  34.62 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.1 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  28.38 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.17 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  31.5 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.53 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  28.82 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.54 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.05 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.05 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.05 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.87 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.63 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  24.31 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.68 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3798  Luciferase-like monooxygenase  32.23 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.535605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.52 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  25.17 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.5 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  37.25 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  35.5 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  33.82 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  28.93 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  28.95 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  27.78 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2621  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.83 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.11 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  23.83 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  26.79 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.05 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  23.83 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  23.83 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  27.45 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.71 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.08 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  27.36 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  27.68 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  28.38 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  26.35 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.64 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  27.75 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  28.46 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  25.23 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 
350 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  30.63 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  23.1 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  28.76 
 
 
353 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 
335 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  29.69 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  25.57 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  26.91 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  23.94 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  26.85 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  26.43 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.74 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  30.38 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  24.66 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  28.51 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  33.58 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.58 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  29.22 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  24.65 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  34.36 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  24.31 
 
 
349 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  22.91 
 
 
436 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  22.91 
 
 
436 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>