More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0217 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  100 
 
 		 334 aa  688    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  78.05 
 
 		 335 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  64.92 
 
 		 329 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  61.16 
 
 		 333 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  61.23 
 
 		 332 aa  431  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  62.39 
 
 		 332 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.94 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  63.89 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  60.86 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  60.55 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  59.94 
 
 		 329 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  57.89 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  45.54 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  43.25 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  43.77 
 
 		 318 aa  262  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  43.08 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  41.85 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  42.64 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  40.8 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  41.28 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  41.67 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  41.67 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  41.67 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  40.55 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  42.15 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  42.07 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  43.34 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  43.69 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  40.92 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  38.15 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  40.24 
 
 		 321 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  39.01 
 
 		 330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  38.65 
 
 		 318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  41.36 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  41.3 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  42.63 
 
 		 343 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  43.65 
 
 		 320 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  42.41 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.04 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  40.44 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  39.14 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  43.21 
 
 		 321 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  40.12 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  37.99 
 
 		 322 aa  222  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  38.58 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  39.76 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  37.15 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  39.26 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  41.56 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  36.89 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  36.89 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  35.67 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  37.99 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  35.37 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  35.37 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  35.37 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  37.73 
 
 		 341 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  37.73 
 
 		 330 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  36.81 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  34.86 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  37.12 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.86 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.7 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  36.5 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  34.45 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.1 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  37.12 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  33.84 
 
 		 336 aa  192  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.28 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  34.12 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.68 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  38.53 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  35.37 
 
 		 338 aa  187  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  36.81 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  35.98 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  38.72 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.84 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  34.64 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  33.13 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  34.24 
 
 		 503 aa  166  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  36.1 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  38.35 
 
 		 260 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  34.57 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  50.53 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.18 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.96 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.91 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.17 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  30.59 
 
 		 282 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.32 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.1 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.86 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  26.88 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.78 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  31.82 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  28.78 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  28.63 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>