283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
343 aa  714    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  77.55 
 
 
363 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  68.47 
 
 
353 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  68.41 
 
 
383 aa  497  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  67.16 
 
 
344 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  63.06 
 
 
330 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  60 
 
 
341 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  57.86 
 
 
336 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  43.79 
 
 
333 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  40.53 
 
 
333 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  41.37 
 
 
333 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.31 
 
 
323 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.44 
 
 
320 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.1 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.38 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.15 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.98 
 
 
320 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.76 
 
 
320 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.76 
 
 
320 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  27.17 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.08 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.04 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.96 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.74 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.95 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.66 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.94 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.52 
 
 
329 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.32 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.22 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.78 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.31 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.59 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.04 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.85 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  31.28 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4778  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.14 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.66 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  23.78 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.07 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  26.37 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  28.63 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  28.63 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  28.63 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  23.78 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 
753 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.45 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  26.4 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  22.87 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
557 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  23.44 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.34 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  26.37 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  25.14 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  30.39 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  23.21 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  25.18 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  25.76 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  29.15 
 
 
543 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  24.78 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  23.73 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.68 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  23.68 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  29.61 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  24.83 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  29.81 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  24.5 
 
 
332 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.62 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  28.4 
 
 
302 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  29.95 
 
 
347 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  29.51 
 
 
298 aa  62.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  21.51 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.01 
 
 
332 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.23 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.99 
 
 
299 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  29.81 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  25.73 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  25.53 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  22.96 
 
 
349 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  23.19 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  23.9 
 
 
359 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  25.73 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  24.78 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  24.26 
 
 
344 aa  59.7  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.42 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.94 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  25.71 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  23.93 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  28.39 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.02 
 
 
314 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.85 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  28 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  27.01 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  23.96 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  27.65 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  27.01 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>