283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4268 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  100 
 
 		 383 aa  776    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  65.5 
 
 		 363 aa  501  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  68.93 
 
 		 353 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  68.41 
 
 		 343 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  67.55 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  64.9 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  61.54 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  57.06 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  43.86 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  40.12 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  36.95 
 
 		 333 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.25 
 
 		 328 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.25 
 
 		 328 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.86 
 
 		 318 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.04 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.3 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.98 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.44 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.44 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.67 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.44 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.3 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.53 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.8 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  30.51 
 
 		 321 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.54 
 
 		 328 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.22 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.75 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.88 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.15 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.69 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.48 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.95 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  26.82 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  31.78 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  25.07 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.71 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.31 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  27.53 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  32 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  32 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.84 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  32 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.73 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  24.48 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  25.53 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  24.72 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  24.71 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  25.17 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  30.6 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.2 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  30.61 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.42 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  23.75 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.56 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  34.85 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  29.85 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.06 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  26.83 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.68 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  22.56 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  24.23 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.11 
 
 		 333 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  24.64 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  25.4 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  26.8 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.25 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.59 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4778  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.8 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  26.47 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  23.26 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  25.75 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  25.75 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  33.12 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  31.78 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  29.61 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  29.79 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  24.01 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  24.38 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  24.38 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.38 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  25.43 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  25.43 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.43 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  26.49 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  25.26 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  27.19 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  32.11 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  31.14 
 
 		 753 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>