More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2003 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 
288 aa  557  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3798  Luciferase-like monooxygenase  73.01 
 
 
290 aa  364  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.535605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  54.29 
 
 
289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2621  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  45.26 
 
 
278 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  54.49 
 
 
317 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.48 
 
 
344 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  47.03 
 
 
323 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.21 
 
 
331 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  51.5 
 
 
316 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  35.24 
 
 
318 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.4 
 
 
328 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.51 
 
 
333 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.44 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  31.31 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.72 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.93 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  32.23 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.79 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.22 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  26.81 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.8 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.8 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  37.82 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.34 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  33.01 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.12 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.15 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  31.78 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.91 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  29.86 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.22 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.41 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  28.25 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.21 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  34.32 
 
 
349 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  34.05 
 
 
336 aa  68.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.5 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  34.24 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  29.63 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0336  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.83 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  33.7 
 
 
360 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.08 
 
 
364 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  33.54 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  29.73 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  28.97 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  22.4 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  27.66 
 
 
543 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.93 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.08 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  32.54 
 
 
350 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.32 
 
 
361 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  38.46 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.09 
 
 
333 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.39 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  30.77 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  32.54 
 
 
350 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  31.82 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  30.77 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.29 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  30.77 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  34.42 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  30.27 
 
 
360 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  30.32 
 
 
353 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.72 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  29.66 
 
 
371 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.28 
 
 
322 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.26 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  35.56 
 
 
343 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.18 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  31.13 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.94 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.27 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  31.89 
 
 
372 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  29.2 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  28.93 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  32.71 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  30.56 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.71 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  30.65 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.21 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  27.19 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.84 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  29.38 
 
 
359 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  25.85 
 
 
321 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  35.44 
 
 
343 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.32 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  32.89 
 
 
362 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  33.12 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  29.27 
 
 
344 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  29.38 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  30.34 
 
 
343 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  27.94 
 
 
316 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 
344 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  23.73 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.23 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  32.52 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  34.64 
 
 
389 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>