More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1388 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
344 aa  693    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  81.21 
 
 
346 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  79.77 
 
 
348 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  68.6 
 
 
351 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  67.63 
 
 
346 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  64.83 
 
 
346 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  64.93 
 
 
345 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  62.9 
 
 
349 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  62.9 
 
 
349 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  63.19 
 
 
346 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  63.19 
 
 
349 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  60.34 
 
 
354 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  59.43 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  59.6 
 
 
346 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  60.98 
 
 
345 aa  408  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  54.49 
 
 
349 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  54.49 
 
 
349 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  53.52 
 
 
342 aa  350  2e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  53.47 
 
 
342 aa  345  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  47.49 
 
 
349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  45.64 
 
 
350 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  45.64 
 
 
350 aa  295  7e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 
349 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  48.33 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.3 
 
 
339 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  45.82 
 
 
344 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.62 
 
 
351 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  45.14 
 
 
348 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  45.01 
 
 
341 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  41.95 
 
 
343 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  44.72 
 
 
343 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  40.87 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  39.72 
 
 
343 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  39.72 
 
 
343 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  44.28 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  42.94 
 
 
352 aa  252  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  41.62 
 
 
347 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  44.61 
 
 
350 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  40.47 
 
 
343 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  40.95 
 
 
352 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  39.59 
 
 
344 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  42.77 
 
 
339 aa  246  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  41.82 
 
 
361 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  42.43 
 
 
346 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  39.94 
 
 
345 aa  232  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  44.01 
 
 
346 aa  232  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  41.03 
 
 
359 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  42.38 
 
 
361 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  40.59 
 
 
372 aa  229  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.88 
 
 
336 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.14 
 
 
333 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.73 
 
 
334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.06 
 
 
332 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  31.59 
 
 
336 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  30.88 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  25.59 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  31.41 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.85 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  28.36 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.41 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  31.33 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.39 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  26.16 
 
 
357 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.02 
 
 
327 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.27 
 
 
322 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  27.3 
 
 
349 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  26.52 
 
 
349 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  27.3 
 
 
349 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  27.76 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  27.76 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.76 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  24.92 
 
 
360 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.95 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  25.45 
 
 
318 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.24 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  26.63 
 
 
353 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  32.65 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  34.9 
 
 
311 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.77 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.88 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  26.25 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  28.06 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.71 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.67 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.46 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.59 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.24 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  25.42 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.18 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  32.28 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  26.14 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  25.62 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  27.12 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  27.73 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  32.61 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  29.48 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  31.8 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  32.41 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  26.82 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>