More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3380 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  100 
 
 
389 aa  781    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  71.16 
 
 
381 aa  568  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  59.89 
 
 
380 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  39.13 
 
 
372 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  39.25 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  37.89 
 
 
391 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  37.89 
 
 
391 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  37.89 
 
 
391 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  27.25 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.81 
 
 
318 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.55 
 
 
328 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.1 
 
 
323 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.97 
 
 
320 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  35 
 
 
299 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.19 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.19 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  37.68 
 
 
754 aa  89.4  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.54 
 
 
328 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  34.29 
 
 
287 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  32.03 
 
 
543 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
320 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.19 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  31.78 
 
 
325 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.31 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
557 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.13 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  30.69 
 
 
336 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  33.65 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
339 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  35.19 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.89 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  30.62 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  30.64 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  36.27 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  27.7 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  34.17 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  39.6 
 
 
519 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  34.17 
 
 
285 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  34.17 
 
 
285 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.27 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  28.91 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.22 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  25.84 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  25.84 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  28.85 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  22.15 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.27 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  25.84 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  37.24 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  29.57 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  34.74 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.46 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  28.24 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  35.63 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.15 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.84 
 
 
507 aa  73.2  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  34.24 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.59 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  33.62 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.35 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  36.55 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  30.04 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.36 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  34.06 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  27.59 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  33.92 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  28.89 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  28.9 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  34.18 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  31.84 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  29.66 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  32.2 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.95 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  31.6 
 
 
284 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  32.78 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.62 
 
 
336 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.98 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  27.21 
 
 
290 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  31.02 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  33.67 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  30.48 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  34.83 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  30.48 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  28.28 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  31.52 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.32 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  28.14 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.89 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.64 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  31.7 
 
 
752 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  28.24 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  30.53 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  34.21 
 
 
531 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.66 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>