More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0254 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 328 aa  660    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  79.69 
 
 		 328 aa  534  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  63.78 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  61.35 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  59.69 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  60.62 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  59.69 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  59.69 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  48.64 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  47.29 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.99 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  49.54 
 
 		 327 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.78 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  40 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.25 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.87 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.15 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.54 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  28.93 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.26 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.43 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.4 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.33 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 		 345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.23 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.3 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.17 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.77 
 
 		 333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  31.44 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  28.4 
 
 		 353 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.6 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  28.53 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  28.87 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.29 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.38 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.15 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.94 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  34.08 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  29.47 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  27.01 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.55 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  30.2 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  30.53 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  27.06 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  27.22 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.71 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  30.58 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.75 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  27.74 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  29.07 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.14 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  31.46 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  26.36 
 
 		 381 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  27.17 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  28.75 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  28.21 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  28.21 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.21 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  29.32 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  30.19 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  25.22 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.32 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  23.38 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  27.92 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  31.82 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  28.52 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  35.75 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  27.11 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  34.09 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.31 
 
 		 356 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.87 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.03 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.32 
 
 		 507 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  34.39 
 
 		 753 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  25.6 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  24.53 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  28.25 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  24.77 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  26.93 
 
 		 342 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  28.73 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.94 
 
 		 351 aa  92.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  28.75 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  27.06 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  26.92 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.78 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  22.77 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  31.86 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  25.51 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  30.19 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  28.99 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  29.06 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  27 
 
 		 389 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  28.72 
 
 		 348 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  29.05 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  26.73 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  30.05 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  27.07 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>