127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0856 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 
356 aa  706    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.19 
 
 
318 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.83 
 
 
328 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.38 
 
 
337 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.23 
 
 
326 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.86 
 
 
349 aa  99.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.04 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.33 
 
 
328 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30 
 
 
323 aa  92  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.62 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.01 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.7 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.04 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.81 
 
 
328 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.01 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.2 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  28 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.31 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.31 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.94 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.51 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.91 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  26.61 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  26.75 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  26.75 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.75 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.25 
 
 
333 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  29.22 
 
 
342 aa  63.2  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  24.66 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  28.76 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  24.66 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.54 
 
 
325 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  27.56 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  31.36 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  32.85 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  32.85 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  32.85 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  28.9 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  28.46 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  33.13 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  33.33 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.38 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.84 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  32.85 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  32.28 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  35.66 
 
 
391 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  30.66 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 
327 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.72 
 
 
339 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  24.91 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  35.66 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  25.38 
 
 
334 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  35.66 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.82 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  33.09 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  28.03 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  25.76 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.87 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  24.58 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  28.67 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.18 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  35.25 
 
 
360 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  27.22 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  24.42 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 
329 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  20.48 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.08 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.08 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  29.68 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.36 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.01 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  25.75 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.25 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  25.43 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.5 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  28.02 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  24.82 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.48 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  28.05 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.38 
 
 
333 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  24.38 
 
 
327 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  24.38 
 
 
327 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  30.36 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  27.66 
 
 
364 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  25.15 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.03 
 
 
318 aa  46.2  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  25.27 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  31.4 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  33.15 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  25 
 
 
454 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  36.11 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  29.34 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.38 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  32.65 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>