More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0300 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 364 aa  723    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  53.64 
 
 		 348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  55.3 
 
 		 335 aa  326  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  55.22 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  55.33 
 
 		 348 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  55.33 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  55.33 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  56.91 
 
 		 340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  53.87 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  55.14 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  52.63 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  49.01 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.16 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  48.36 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  48.36 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  45.15 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  47.02 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  46.53 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  44.37 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  43.79 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  47.04 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  44.75 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  38.13 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  32.91 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  32.59 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  32.27 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  32.27 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  33.55 
 
 		 341 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  33.56 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  33.56 
 
 		 349 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  36.09 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  36.09 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  33.22 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.09 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.54 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  30.94 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.8 
 
 		 361 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  29.81 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  33.85 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.62 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.99 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.81 
 
 		 302 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  31.15 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.44 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  32.63 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  31.56 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  31.79 
 
 		 283 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  28.67 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.86 
 
 		 327 aa  89.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  32.02 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4580  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  30.53 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29.5 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.91 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  33.66 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.68 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.57 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.43 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  32.23 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.82 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  30.82 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  28.44 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.9 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  28.19 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  28.19 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  28.47 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  28.19 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  40.91 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  34.02 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.19 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  29.73 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.5 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.66 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.6 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  29.43 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.39 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.4 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  28.99 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  29.67 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  33.69 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  31.03 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  27.34 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  30.41 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  30.41 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  28.04 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  30.41 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  28.63 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  28.41 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  29.69 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  21.8 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  36.99 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13212  hypothetical protein  40.37 
 
 		 153 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.845134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.2 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>