More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0484 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  100 
 
 
330 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  62.7 
 
 
322 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  59.81 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  62.74 
 
 
319 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  60.88 
 
 
321 aa  384  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  57.28 
 
 
321 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  57.86 
 
 
321 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  54.89 
 
 
318 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  53.31 
 
 
318 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  55.35 
 
 
320 aa  349  4e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  53.14 
 
 
318 aa  332  6e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  49.69 
 
 
318 aa  316  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  47.6 
 
 
320 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  44.97 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  43.57 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  43.73 
 
 
321 aa  272  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  46.88 
 
 
338 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  46.47 
 
 
321 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  42.45 
 
 
321 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.27 
 
 
325 aa  252  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  40.38 
 
 
322 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  39.63 
 
 
379 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  38.68 
 
 
320 aa  238  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  39.01 
 
 
334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  38.99 
 
 
503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  42.12 
 
 
322 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  38.08 
 
 
328 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.35 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  37.42 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  37.77 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  35.38 
 
 
329 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.66 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  36.2 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  38.17 
 
 
334 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  36.01 
 
 
330 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  36.01 
 
 
341 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  36.01 
 
 
330 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  37.5 
 
 
329 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  33.94 
 
 
333 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 
342 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  34.86 
 
 
332 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.25 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  34.86 
 
 
332 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  36.05 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  36.56 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.94 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  34.46 
 
 
331 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  37.88 
 
 
332 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.51 
 
 
326 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  32.7 
 
 
325 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.95 
 
 
339 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.56 
 
 
349 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  34.95 
 
 
325 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  40.55 
 
 
260 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  35.6 
 
 
325 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  36.25 
 
 
318 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  33.43 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.08 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  34.69 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  33.64 
 
 
336 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  33.64 
 
 
336 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  32.93 
 
 
336 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  34.33 
 
 
336 aa  175  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  31.9 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  32.13 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  33.43 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  33.43 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  33.43 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  34.17 
 
 
329 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  34.17 
 
 
329 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  35.31 
 
 
320 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  34.17 
 
 
329 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  33.02 
 
 
321 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  31.02 
 
 
337 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  35.94 
 
 
320 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  31.09 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  36.25 
 
 
320 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  36.14 
 
 
323 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  32.92 
 
 
325 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  32.81 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.12 
 
 
342 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.09 
 
 
331 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.09 
 
 
331 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  65.98 
 
 
287 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  32.48 
 
 
343 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  31.53 
 
 
343 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.1 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  32.07 
 
 
294 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  32.8 
 
 
287 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 
364 aa  86.7  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  32.2 
 
 
372 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.24 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  31.03 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  31.41 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  30.96 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  32.78 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.92 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  32 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>