More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 325 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  74.38 
 
 		 321 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  67.39 
 
 		 322 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  61.13 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  68.28 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  50.94 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  50.31 
 
 		 320 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  50.96 
 
 		 379 aa  307  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  48.9 
 
 		 322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  46.11 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  47.2 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  45.82 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  46.69 
 
 		 334 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  45.2 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  47.52 
 
 		 503 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  45.94 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  45.15 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  45.15 
 
 		 341 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  45.15 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  43.27 
 
 		 330 aa  268  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  45 
 
 		 318 aa  268  8.999999999999999e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  44.58 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  46.67 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  40.31 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  41 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  45.77 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  44.41 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  43.63 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  42.58 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  45.48 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  41.19 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  42.33 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  42.09 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  44.71 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  39.14 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.99 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  37.96 
 
 		 329 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  36.65 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  38.14 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  37.24 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  35.54 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  36.83 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  35.61 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  36.96 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  33.62 
 
 		 338 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  33.83 
 
 		 336 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  36.64 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.14 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  36.25 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  32.42 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  33.53 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.47 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.93 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  35.84 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  33.83 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  33.23 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  33.23 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  33.23 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  35.29 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  35.58 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  33.44 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  36.28 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  33.33 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  36.59 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  35.91 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.64 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  36.88 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  35.6 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  34.82 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.65 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  34.8 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  36.91 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  35.28 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  35.28 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  35.28 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  36.86 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  29.79 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.55 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.33 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  38.39 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.37 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.64 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  34.84 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  35.99 
 
 		 320 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  33.44 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.27 
 
 		 343 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  63.64 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  38.5 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  34.86 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  38.55 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  35.68 
 
 		 543 aa  90.1  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0336  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.53 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  37.69 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  38.79 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.53 
 
 		 507 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  38.51 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  37.11 
 
 		 754 aa  86.3  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 		 364 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.77 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  34.16 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>