More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2848 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
346 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  81.21 
 
 
344 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  80.06 
 
 
348 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  68.7 
 
 
346 aa  501  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  68.41 
 
 
351 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  63.66 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  63.37 
 
 
345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  62.21 
 
 
349 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  64.64 
 
 
346 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  61.92 
 
 
349 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  61.92 
 
 
349 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  60.06 
 
 
354 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  62.43 
 
 
345 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  60.17 
 
 
346 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  60.68 
 
 
355 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  54.62 
 
 
349 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  54.62 
 
 
349 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  53.66 
 
 
342 aa  352  4e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  54.23 
 
 
342 aa  348  8e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  45.69 
 
 
349 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  43.35 
 
 
350 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  43.35 
 
 
350 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  47.52 
 
 
339 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  46.81 
 
 
349 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  43.84 
 
 
344 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.87 
 
 
339 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  42.17 
 
 
343 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  42.17 
 
 
343 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  42.17 
 
 
343 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  41.6 
 
 
343 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  44.35 
 
 
352 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
347 aa  256  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.07 
 
 
352 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  43.93 
 
 
350 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.2 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  41.03 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  41.74 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  42.6 
 
 
343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  45.45 
 
 
372 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  42.73 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  44.51 
 
 
361 aa  242  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  45.62 
 
 
348 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  45.62 
 
 
341 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  40.66 
 
 
361 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
345 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  43.11 
 
 
346 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  39.82 
 
 
359 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  40.29 
 
 
346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  38.76 
 
 
372 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.14 
 
 
333 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.87 
 
 
336 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.85 
 
 
334 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  27.19 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.63 
 
 
332 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  32.85 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  28.92 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  31.03 
 
 
335 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.5 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.39 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  27.33 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  29.94 
 
 
346 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  28.67 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  28.8 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.92 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  28.8 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  27.4 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.8 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  28.9 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.02 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.78 
 
 
337 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  25.24 
 
 
318 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.39 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.03 
 
 
333 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  24.55 
 
 
322 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  27.88 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.08 
 
 
349 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25.4 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.7 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.93 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  24.24 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.85 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.04 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  26.54 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  33.56 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.36 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.88 
 
 
507 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  32.55 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  27.33 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  32.75 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.91 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  24.84 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  31.14 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  27.66 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  24.61 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.66 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  25.89 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.48 
 
 
320 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  29.23 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>