More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2391 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  100 
 
 		 351 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  68.41 
 
 		 346 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  67.83 
 
 		 348 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  68.6 
 
 		 344 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  63.08 
 
 		 345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  62.82 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  62.54 
 
 		 349 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  62.54 
 
 		 349 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  63.48 
 
 		 346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  61.34 
 
 		 346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  62.9 
 
 		 346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  56.5 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  61.38 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  57.88 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  56.07 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  54.05 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  54.05 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  54.22 
 
 		 342 aa  345  8e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  51.9 
 
 		 342 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  48.94 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  44.7 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  46.18 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  44.13 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  48.01 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  43.97 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.07 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.48 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  41.88 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  40.57 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  40.62 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  44.44 
 
 		 341 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  43.06 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  40.62 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  40.62 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  40.62 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  45.76 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  42.86 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  41.95 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  42.15 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  39.94 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  44.1 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 347 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  42.94 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.27 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  40.84 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  42.38 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  45.13 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.49 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.18 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  33.44 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.81 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.44 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  25.73 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.21 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  36.4 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  31.31 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  32.74 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.5 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  30.55 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  26.9 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  30.06 
 
 		 344 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.59 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.45 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  28.72 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.39 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  29.08 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.31 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.71 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.27 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.04 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.03 
 
 		 507 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  33.74 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  25.61 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.39 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.77 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  30.59 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  32.85 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  27.05 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  30.39 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  27.05 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.05 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 543 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  30.72 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.71 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.42 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  31.13 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  32.22 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.22 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  29.08 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.32 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  25.94 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.48 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13110  oxidoreductase  26.67 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  31.79 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  32.24 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>