More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3812 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 339 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  73.81 
 
 		 339 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  64.65 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.45 
 
 		 352 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  54.55 
 
 		 343 aa  348  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  52.69 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  54.84 
 
 		 341 aa  335  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  51.32 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  52.65 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  52.65 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  52.35 
 
 		 343 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  51.61 
 
 		 343 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  53.15 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  53.96 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  50.91 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  49.27 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  49.85 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  52.71 
 
 		 346 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  53.8 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  49.15 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  50.15 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  45.83 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  48.94 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  48.41 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  48.14 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  47.55 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  50.61 
 
 		 351 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  46.27 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  45.54 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  43.6 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  47.94 
 
 		 361 aa  252  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  42.9 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  47.85 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  45.71 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  42.77 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  42.46 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  42.73 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  43.16 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  43.16 
 
 		 349 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  43.16 
 
 		 349 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  42.09 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  42.77 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  42.15 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  45.78 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  43.21 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  40.95 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  40.95 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  37.42 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  35.2 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.47 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.02 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.78 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.87 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.72 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.38 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  28.85 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.52 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.59 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.61 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  27.76 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.35 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.81 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.35 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.35 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.11 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  35.81 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  30.71 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.72 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  33.33 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  26.18 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.8 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.89 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  29.24 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.99 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  28.76 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  27.3 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  26.46 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.24 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  28.51 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.53 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  27.27 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  28.01 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.01 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  25.56 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  25.56 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  25.56 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.73 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.41 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  27.93 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.64 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  31.42 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  28.12 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  28.25 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  26.85 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>