More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2599 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  100 
 
 		 348 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  93.24 
 
 		 341 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  66.57 
 
 		 352 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  67.07 
 
 		 372 aa  437  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  68.9 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  58.74 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  61.89 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  56.98 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  56.85 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  55.98 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  55.98 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  55.98 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  55.1 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  54.23 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  53.94 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  54.2 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  55.36 
 
 		 345 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  54.6 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  52.46 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  53.96 
 
 		 339 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  49.08 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  47.55 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  50.15 
 
 		 349 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  45.4 
 
 		 350 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  45.14 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  45.11 
 
 		 350 aa  278  7e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  48.04 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  49.38 
 
 		 346 aa  272  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  45.32 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.93 
 
 		 351 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  48.11 
 
 		 345 aa  262  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.62 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  46.39 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  41.64 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  45.18 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  43.06 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  44.95 
 
 		 346 aa  252  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  49.67 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  45.66 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  45.66 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  45.66 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  45.51 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  42.73 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  43.9 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  42.42 
 
 		 355 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.71 
 
 		 361 aa  218  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  42.94 
 
 		 349 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  42.94 
 
 		 349 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.02 
 
 		 336 aa  165  9e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  36.76 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.73 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.54 
 
 		 334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.22 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  27.76 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.27 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  31.29 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  32.66 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  29.65 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  30.14 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  31.06 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  30.14 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  31.19 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  31.19 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.19 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  30.14 
 
 		 349 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.6 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  31.7 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  34.87 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  31.86 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  30.13 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.07 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.13 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  29.79 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  29.79 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  29.79 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  28.74 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  28.74 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  31.68 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  33.16 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  31.51 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  30.37 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  31.15 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  31.15 
 
 		 353 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  31.15 
 
 		 353 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  34.26 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  25.93 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  29.77 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.57 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  27.41 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.32 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.37 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  33.7 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  32.68 
 
 		 330 aa  85.9  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.51 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  34.52 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.8 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  31.25 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  37.82 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>