262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2916 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  100 
 
 		 330 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3116  luciferase family protein  90.12 
 
 		 324 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878039  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  64.26 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  58.94 
 
 		 322 aa  348  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  59.47 
 
 		 318 aa  345  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  54.49 
 
 		 318 aa  342  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  54.87 
 
 		 321 aa  311  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  52.48 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  48.73 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.65 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.55 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  22.46 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  32.3 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.23 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  29.38 
 
 		 343 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  29.38 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  29.38 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  31.36 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  29.74 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.23 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  29.14 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 345 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  29.15 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  27.96 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  27.3 
 
 		 357 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  37.95 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.14 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  32.76 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.54 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.35 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  28.26 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  33.23 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.71 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.13 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 339 aa  89.4  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  28.48 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.16 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  30.19 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  31.2 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  32.68 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.56 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  29.8 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  32.89 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  31.76 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.29 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  32.53 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.67 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  35.19 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.71 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  31.51 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  34.32 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  31.72 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.71 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  31.72 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  29.19 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  31.72 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  27.87 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  27.87 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  27.87 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  31.39 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  29.66 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25.75 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  27.36 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.88 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  39.74 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  33.7 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.82 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  33.63 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  32.79 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  28.31 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  27.76 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  36.51 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  31.51 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1533  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.7 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0346737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.98 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  33.15 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.77 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  30.74 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13110  oxidoreductase  30.45 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  28.24 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  30.49 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  30.11 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.15 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  29.29 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.45 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  28.77 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  29.06 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  39.51 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  29.03 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  39.51 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  39.51 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  33.6 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>