269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3116 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3116  luciferase family protein  100 
 
 		 324 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878039  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  90.12 
 
 		 330 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  63.58 
 
 		 327 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  58.53 
 
 		 322 aa  338  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  59.4 
 
 		 318 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  55.18 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  55.63 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  53.36 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  48.37 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.12 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.39 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  32.26 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  22.34 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.23 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  29.25 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.75 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  28.79 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  28.79 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  28.79 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.9 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 347 aa  99  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  31.12 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.83 
 
 		 339 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  29.41 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  27.53 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  27.83 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.67 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 339 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  28.72 
 
 		 357 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  36.75 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  37.89 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.73 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  27.33 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  34.34 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  31.03 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.15 
 
 		 361 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.02 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  37.02 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  34.51 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  37.02 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  37.02 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.33 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  32.28 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  34.08 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  34.8 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  35.8 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.04 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  32.02 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  32.72 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.41 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.13 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  39.74 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  31.13 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.46 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  27.83 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  28.62 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  36.45 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  28.2 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  34.91 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.8 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  35.58 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  35.58 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  31.56 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  35.58 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  36.67 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  26.49 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  26.49 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  26.49 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  27.4 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  28.57 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.22 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  33.33 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.17 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  28.47 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  35.26 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  32.72 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.13 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  40.48 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  23.78 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  29.18 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  29.18 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  31.01 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  32.18 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.76 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  35.67 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.58 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  31.6 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  39.51 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  39.51 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>