More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1412 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  100 
 
 
318 aa  636    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  66.35 
 
 
318 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  69.18 
 
 
318 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  69.18 
 
 
318 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  67.61 
 
 
317 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  69.18 
 
 
318 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  66.67 
 
 
317 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  56.11 
 
 
318 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  52.55 
 
 
318 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  52.55 
 
 
318 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  52.55 
 
 
318 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  51.59 
 
 
318 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  51.27 
 
 
318 aa  341  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  39.39 
 
 
311 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  41.16 
 
 
309 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.67 
 
 
302 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  41.64 
 
 
309 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  41.64 
 
 
309 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.49 
 
 
298 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  40.06 
 
 
309 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  40.25 
 
 
304 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  39.43 
 
 
304 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  39.12 
 
 
304 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  40.79 
 
 
301 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  40.13 
 
 
304 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  39.8 
 
 
309 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  42.09 
 
 
301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  37.35 
 
 
300 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  38.04 
 
 
309 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  40.71 
 
 
283 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 
296 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  35.29 
 
 
306 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  30.97 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  31.01 
 
 
329 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  44.06 
 
 
143 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  29.96 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  31.92 
 
 
372 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.62 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  29.96 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  30.66 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  35.64 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.12 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.93 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.33 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  30.59 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  28.14 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  27.92 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  27.92 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  28.28 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  28.26 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  34.69 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  30.29 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  26.69 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  32.66 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  31.48 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  26.39 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.84 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  32.75 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  29.92 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.15 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.03 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  33.53 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  31.16 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  29.52 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  32.16 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  32.16 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  31.46 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  30.97 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  29.82 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  30.99 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  30.99 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  32.74 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  33.62 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  28.65 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  29.82 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  30.65 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  26.85 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  33.53 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  19.69 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  30.35 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.61 
 
 
352 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.21 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  27.73 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  23.94 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  27.66 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  27.66 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  31.03 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  26.09 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  23.35 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  28.07 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  28.07 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  28.07 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  30.5 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  32.7 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  31.52 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>