More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3287 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 
321 aa  633  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  61.56 
 
 
318 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  59.94 
 
 
318 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  58.18 
 
 
327 aa  349  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  59.25 
 
 
360 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  57.1 
 
 
322 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  54.87 
 
 
330 aa  293  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  49.66 
 
 
353 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3116  luciferase family protein  55.63 
 
 
324 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878039  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.11 
 
 
336 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.19 
 
 
333 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.18 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.63 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  30.23 
 
 
360 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  30.94 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.1 
 
 
318 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  30.07 
 
 
341 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  33.33 
 
 
317 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  32.39 
 
 
283 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29.39 
 
 
327 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.19 
 
 
302 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  34.01 
 
 
309 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.91 
 
 
298 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  27.46 
 
 
346 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.62 
 
 
339 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  26.88 
 
 
345 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.81 
 
 
349 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  30.27 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.68 
 
 
327 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  32.87 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  28.18 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  32.98 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  28.8 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.52 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.48 
 
 
350 aa  93.2  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  31.01 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  30.15 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  26.13 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  26.13 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  26.13 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  29.75 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  35.59 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.91 
 
 
335 aa  89.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
344 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  30.3 
 
 
348 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.3 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  31.58 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  31.58 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  31.58 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.23 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.38 
 
 
351 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  28.53 
 
 
372 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  30 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  32.76 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25.38 
 
 
348 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  33.45 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  28.84 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  33.45 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  33.45 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  27.71 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  28.12 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  31.46 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  28.62 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  33.09 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  30.03 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.22 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  25.95 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  30.37 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  28.79 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  28.71 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  26.75 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  26.9 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  29.43 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  26.9 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  28.04 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  25 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  24.4 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.58 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  26.4 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.95 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  33.53 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.9 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  29.84 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  27.73 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13110  oxidoreductase  27.61 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  28.48 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  27.73 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  29.21 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  29.75 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.36 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  26.86 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.67 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  26.71 
 
 
345 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  28.67 
 
 
297 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>