More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4259 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  100 
 
 
318 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  95.91 
 
 
318 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  92.14 
 
 
318 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  92.14 
 
 
318 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  92.14 
 
 
318 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  77.04 
 
 
318 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  54.78 
 
 
318 aa  364  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  51.27 
 
 
318 aa  341  9e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  52.66 
 
 
317 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  50.78 
 
 
317 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  50.96 
 
 
318 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  50.96 
 
 
318 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  50.96 
 
 
318 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  42.52 
 
 
309 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  37.26 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.59 
 
 
302 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  38.56 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  38.56 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  38.56 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  40.88 
 
 
304 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.85 
 
 
298 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  37.66 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  38.89 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  37.54 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  41.43 
 
 
283 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  37.78 
 
 
309 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  38.36 
 
 
304 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  39.73 
 
 
296 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  31.51 
 
 
309 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  34.28 
 
 
300 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  33.33 
 
 
306 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  39.3 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
329 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  42.96 
 
 
143 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  31.06 
 
 
359 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.39 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  30.25 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.63 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
320 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  33.07 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.76 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  30.12 
 
 
339 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  32.87 
 
 
321 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.45 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.89 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.03 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 
372 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  30.39 
 
 
345 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.17 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  20.07 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.7 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  29.76 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  28.74 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  29.02 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  33.2 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.93 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  28.39 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  28.08 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.62 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  32.73 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.96 
 
 
352 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  28.65 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  28.65 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  28.65 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  27 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  27.22 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  25.87 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  33.11 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  29.57 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  28.27 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  32.81 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  26.52 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  25.85 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  27.6 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.53 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  30.04 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  25.3 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.27 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.22 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.16 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  31.1 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.64 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  29.03 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  28.98 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  26.69 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.43 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  28.99 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  25.52 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  25.48 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  28.1 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  27.68 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  23.83 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>