More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0205 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
318 aa  643    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  65.02 
 
 
328 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  63.78 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  56.15 
 
 
320 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  55.84 
 
 
323 aa  368  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  56.47 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  56.15 
 
 
320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  56.15 
 
 
320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.47 
 
 
328 aa  276  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.6 
 
 
328 aa  275  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.9 
 
 
328 aa  276  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.64 
 
 
335 aa  272  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  44.31 
 
 
327 aa  258  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.63 
 
 
326 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.56 
 
 
326 aa  232  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.37 
 
 
349 aa  232  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.49 
 
 
337 aa  225  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.04 
 
 
327 aa  202  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.37 
 
 
336 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.67 
 
 
325 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.97 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.12 
 
 
333 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.93 
 
 
335 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.22 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.51 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  31.94 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  30.86 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.28 
 
 
344 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  30.63 
 
 
317 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.97 
 
 
333 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.68 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  30.84 
 
 
343 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  30.33 
 
 
353 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.1 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.38 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  30.57 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.92 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  27.76 
 
 
381 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.43 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  29.03 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.62 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.42 
 
 
334 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.44 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.76 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.25 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.39 
 
 
340 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.39 
 
 
340 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.39 
 
 
340 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  30.72 
 
 
350 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
339 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.19 
 
 
356 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.07 
 
 
339 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  30.16 
 
 
339 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  27.18 
 
 
327 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.29 
 
 
332 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
344 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  31.16 
 
 
317 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
344 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  30.72 
 
 
350 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
345 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  27.19 
 
 
352 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  29.32 
 
 
349 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  29.28 
 
 
343 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  29.28 
 
 
343 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.58 
 
 
351 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  29.28 
 
 
343 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26 
 
 
321 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  28.48 
 
 
349 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.01 
 
 
327 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  28.92 
 
 
341 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  28.62 
 
 
341 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.1 
 
 
321 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  28.85 
 
 
333 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  28.8 
 
 
343 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  28.12 
 
 
342 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 
349 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  26.67 
 
 
359 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.66 
 
 
345 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  27.65 
 
 
343 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  27.81 
 
 
389 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  32.89 
 
 
360 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
344 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  28.62 
 
 
349 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  34.18 
 
 
289 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  29.47 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.62 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  25.45 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  26.4 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  27.93 
 
 
346 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  25.47 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  27.57 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.56 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  27.1 
 
 
336 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 
372 aa  96.3  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
346 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.21 
 
 
318 aa  95.9  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  30.34 
 
 
341 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>