More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2731 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  100 
 
 
352 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  63.82 
 
 
347 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  62.39 
 
 
343 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  62.11 
 
 
343 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  60.97 
 
 
344 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  63.53 
 
 
343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  63.53 
 
 
343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  62.32 
 
 
345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  63.25 
 
 
343 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.11 
 
 
352 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  56.98 
 
 
348 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  56.53 
 
 
341 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  56.64 
 
 
372 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  54.86 
 
 
361 aa  351  8.999999999999999e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  51.97 
 
 
343 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  52.23 
 
 
339 aa  342  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  50.28 
 
 
346 aa  335  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  51.04 
 
 
339 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  48.48 
 
 
372 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  49.85 
 
 
339 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  44.31 
 
 
346 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  43.36 
 
 
344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  43.11 
 
 
349 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  44.35 
 
 
346 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  43.03 
 
 
349 aa  252  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  44.76 
 
 
345 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  42.99 
 
 
348 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  43.67 
 
 
345 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  40.95 
 
 
344 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  43.98 
 
 
346 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.51 
 
 
351 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  42.73 
 
 
346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  40.48 
 
 
359 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  40.5 
 
 
350 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  41.19 
 
 
342 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  40.22 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  41.69 
 
 
349 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  41.69 
 
 
349 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  41.64 
 
 
349 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  43.2 
 
 
355 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.94 
 
 
361 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  40 
 
 
346 aa  228  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  39.94 
 
 
351 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  40.86 
 
 
342 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  42.41 
 
 
346 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  39.36 
 
 
350 aa  222  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  39.43 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  40.36 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  40.36 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
336 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.01 
 
 
334 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.77 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  32.69 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.47 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  30.68 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.23 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.95 
 
 
327 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  30.15 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  25.58 
 
 
321 aa  116  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  27.68 
 
 
357 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  38.83 
 
 
346 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.19 
 
 
318 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  27.99 
 
 
327 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.02 
 
 
322 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.67 
 
 
318 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  26.82 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.07 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  27.97 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  27.97 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.97 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  28.3 
 
 
348 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  28.3 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  28.3 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  25.08 
 
 
349 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  26.77 
 
 
318 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.08 
 
 
349 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  26.11 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.95 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.65 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  31.65 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  29.48 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  29.03 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  25.91 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  26.32 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  30.05 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.2 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  33.33 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.8 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  31.94 
 
 
391 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  31.94 
 
 
391 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.88 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  31.94 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  28.48 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  25.78 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  34.73 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1533  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.14 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0346737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  28.57 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  28.62 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  28.91 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  30.04 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>