More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0950 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
372 aa  761    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  61.14 
 
 
352 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  56.63 
 
 
372 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  59.31 
 
 
341 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  58.74 
 
 
346 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  58.74 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  60.17 
 
 
361 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  51.73 
 
 
347 aa  362  6e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  51.63 
 
 
343 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  51.63 
 
 
344 aa  355  8.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  50.29 
 
 
343 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  51.04 
 
 
343 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  50 
 
 
343 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  50 
 
 
343 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  48.48 
 
 
352 aa  347  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  48.66 
 
 
345 aa  328  8e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  50.14 
 
 
339 aa  326  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  47.79 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  49.15 
 
 
339 aa  318  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  45.48 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  43.21 
 
 
349 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  44.97 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  44.41 
 
 
350 aa  275  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  43.85 
 
 
350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  44.21 
 
 
349 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  40.28 
 
 
348 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  45.48 
 
 
359 aa  258  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.28 
 
 
351 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  41.12 
 
 
346 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  41.89 
 
 
345 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  40.59 
 
 
344 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  40.71 
 
 
346 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  41.59 
 
 
346 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
346 aa  239  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  39.88 
 
 
349 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  39.88 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  39.88 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.76 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  41.54 
 
 
342 aa  232  9e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  40.12 
 
 
346 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  38.82 
 
 
345 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  41.94 
 
 
350 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  40.84 
 
 
351 aa  225  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.47 
 
 
361 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  37.04 
 
 
342 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  36.84 
 
 
354 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  38.11 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  36.72 
 
 
349 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  36.72 
 
 
349 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.25 
 
 
336 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.71 
 
 
334 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.88 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  30.51 
 
 
335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.77 
 
 
332 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  31.66 
 
 
336 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.85 
 
 
327 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  28.25 
 
 
341 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  21.94 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  28.52 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  26.58 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  26.91 
 
 
357 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 
327 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  30.95 
 
 
346 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.73 
 
 
322 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
318 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  26.75 
 
 
360 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  23.86 
 
 
349 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.09 
 
 
318 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  28.03 
 
 
348 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  27.71 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  27.71 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  23.7 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  23.53 
 
 
349 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.04 
 
 
298 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.38 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  23.97 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  27.18 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  24.76 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  29.68 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  24.76 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.76 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  30.35 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  31.13 
 
 
301 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  27.03 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.16 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  25.72 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  32.77 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  26.06 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  29.71 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  25.95 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  26.16 
 
 
348 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.48 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.04 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  30.54 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  23.75 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  27.8 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  25.41 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  25.41 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  25.41 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>