More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3959 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  100 
 
 		 342 aa  700    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  92.92 
 
 		 341 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  65.17 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  59.7 
 
 		 341 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  46.18 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  45.32 
 
 		 348 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  45.32 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  45.32 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  45 
 
 		 340 aa  300  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  46.23 
 
 		 343 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  42.82 
 
 		 335 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  43.71 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  45.71 
 
 		 352 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  40.47 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  44.03 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.13 
 
 		 349 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  41.34 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  39.45 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  39.45 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  39.14 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  39.54 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  39.54 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  39.61 
 
 		 333 aa  208  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  39.22 
 
 		 341 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  39.22 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  39.22 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  39.42 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  35.26 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  33 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  33.33 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  33 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  32.47 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.47 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  32.47 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  30.52 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.62 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  28.2 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.58 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.74 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.17 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.56 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.22 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.58 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.81 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.37 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  30.8 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.47 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.89 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  24.92 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.78 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  30.49 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4580  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  30.9 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  29.96 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.01 
 
 		 350 aa  89.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.6 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.62 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  31.38 
 
 		 309 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  27.36 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13212  hypothetical protein  36.55 
 
 		 153 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.845134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  26.97 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  31.23 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  28.96 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  27.38 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  29.32 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.74 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  25.89 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  26.59 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  27.31 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  27.31 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  27.31 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  26.81 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  30.96 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.68 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  27.52 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  29.29 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  33.2 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  27.86 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  26.37 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  28.76 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  26.47 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  25.56 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.09 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  25.67 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  30.99 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.15 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  25.67 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  28.71 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  25.67 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  25.38 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  25.93 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  29.92 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  26.09 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  29.09 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  25.42 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>