209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0879 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  99.7 
 
 
338 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  87.76 
 
 
337 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  87.83 
 
 
341 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  42.77 
 
 
341 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  39.54 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  39.22 
 
 
342 aa  212  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  37.38 
 
 
342 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13212  hypothetical protein  65.1 
 
 
153 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.845134 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  33.98 
 
 
340 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  32.41 
 
 
343 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  30.94 
 
 
348 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  30.94 
 
 
353 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  30.94 
 
 
353 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  29.06 
 
 
335 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  29.84 
 
 
337 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  35.55 
 
 
325 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.7 
 
 
349 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  35.18 
 
 
340 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  31.87 
 
 
345 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  31.82 
 
 
348 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  33.67 
 
 
327 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  32.75 
 
 
352 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  34.01 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  32.18 
 
 
364 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
333 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  28.23 
 
 
349 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.83 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.83 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.83 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  28.23 
 
 
349 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  28.57 
 
 
349 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.39 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  28.73 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.15 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.72 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  29.87 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  32.12 
 
 
304 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.28 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  29.33 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.57 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.55 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.82 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  32.14 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  25.45 
 
 
357 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.26 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  31.33 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  30.89 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.05 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  31.58 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  27.08 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.49 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  26.27 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.48 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.67 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  26.18 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  28.66 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  26.67 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  27.45 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  31.06 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  28.33 
 
 
311 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  29.88 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  29.03 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  29.03 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  28.08 
 
 
317 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  28.12 
 
 
327 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.02 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  27.01 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  28.05 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  24.39 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  31.85 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  31.22 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.64 
 
 
327 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  26.58 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  26.58 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  26.58 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  29.76 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  27.99 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  23.55 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.2 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  28.63 
 
 
309 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  26.36 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  25.83 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  28.15 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  23.55 
 
 
347 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  23.55 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  31.35 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.68 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  27.67 
 
 
359 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  24.79 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  28.91 
 
 
350 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  29.29 
 
 
350 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  27.35 
 
 
346 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>