More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1615 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 		 349 aa  710    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  51.92 
 
 		 348 aa  325  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  50.16 
 
 		 348 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  50.16 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  50.16 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  47.38 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  50.87 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  46.01 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  45.48 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  47.35 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  45.05 
 
 		 352 aa  268  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  49.65 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  42.58 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  42.05 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  40.76 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  44.16 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  40.13 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  44.16 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  44.16 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  41.69 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  40.43 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  38.25 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  33.89 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  31 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  30.7 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  30.7 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  33.56 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  30.54 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  29.76 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  29.67 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  30.46 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  30.46 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.46 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  29.97 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.98 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  29.29 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  28.67 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.97 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  28.41 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  27.3 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.02 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  26.77 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25.94 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  25.86 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4580  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  28.03 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25.08 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  24.76 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.7 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  26.58 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.16 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  31.49 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  25.91 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  23.81 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  30.93 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  23.81 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  24.27 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  36.44 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  25.08 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  25.31 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  27.74 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.64 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  25.5 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.69 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  25.6 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  29.8 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  25.6 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  24.67 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.04 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.06 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  26.14 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  26.14 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  26.14 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  30.16 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  30.16 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  26.38 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  30.3 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  24.89 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  20.86 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  24.67 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  28.97 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  26.73 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  23.08 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  25.86 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  25.51 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  26.32 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  25.17 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  32.2 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>