More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3961 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 333 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  64.33 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  63.72 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  63.72 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  62.8 
 
 		 325 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  61.98 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  46.6 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  45.62 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  45.62 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  45.62 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  44.69 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  45.12 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  46.76 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  44.06 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  40.71 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  41.33 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  41.56 
 
 		 352 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  44.48 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  42.77 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  40.67 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  40 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.25 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  31.08 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  32.06 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  30.29 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  29.97 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  29.97 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  30.23 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  29.21 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.96 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  28.67 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  28.67 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.21 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.21 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.21 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  28.67 
 
 		 349 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  28.1 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  29.02 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  29.02 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  29.02 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.49 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.16 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.27 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  28.62 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  20.65 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  28.57 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  26.34 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  28.33 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  29.66 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  29.66 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  29.66 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  29.28 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.86 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  26.1 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  30.24 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  25.89 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  25.2 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13212  hypothetical protein  36.67 
 
 		 153 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.845134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.03 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.48 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  28.95 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  27.67 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.78 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  27.27 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.33 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  27.83 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  34.48 
 
 		 775 aa  63.2  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  29.44 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.51 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.18 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.18 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.41 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.41 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  27.94 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.07 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.83 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  29.91 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.57 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  33.79 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.09 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  35.04 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  24.69 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  32.19 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  29.43 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.39 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  27.48 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  26.1 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.23 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  30.5 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  32.95 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  28.4 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  30.38 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>