More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2504 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 344 aa  701    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  82.22 
 
 		 347 aa  594  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  82.51 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  82.51 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  82.22 
 
 		 343 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  79.01 
 
 		 343 aa  567  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  78.43 
 
 		 343 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  65.22 
 
 		 345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  60.97 
 
 		 352 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.72 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  52.62 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  54.24 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  53.05 
 
 		 339 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  53.94 
 
 		 341 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  52.71 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  53.94 
 
 		 348 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  56.4 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  51.63 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  50.91 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  48.85 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  41.08 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  43.64 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  43.94 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  43.58 
 
 		 346 aa  255  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  41.74 
 
 		 346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  41.77 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  39.59 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  42.4 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  41.76 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  40.91 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  39.33 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  39.49 
 
 		 349 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  39.49 
 
 		 349 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  40.46 
 
 		 342 aa  238  8e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  43.71 
 
 		 346 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  39.2 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  40.6 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.03 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  38.35 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  41.52 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  39.83 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  39.83 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.25 
 
 		 361 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  39.39 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  38.55 
 
 		 342 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  29.77 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.37 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.06 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.85 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  30.52 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.7 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.92 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  24.6 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  28.57 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.36 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  27.59 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  28.62 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.22 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.58 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  25.39 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  28.32 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.65 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.09 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  25.23 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  25.86 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  28.95 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  28.95 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  28.95 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  24.65 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.93 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.96 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.96 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.96 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  25.31 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  25.62 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  27 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  27 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  28.02 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  26.77 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  30.32 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.31 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.14 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  29.87 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.74 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.64 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  26.41 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  28.57 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.74 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  25.85 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  34.87 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  30.38 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  28.19 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  32.29 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  28.67 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  26.19 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>