More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1995 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 346 aa  695    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  67.83 
 
 		 348 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  67.63 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  66.18 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  65.32 
 
 		 346 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  64.74 
 
 		 349 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  64.74 
 
 		 349 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  64.64 
 
 		 346 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  64.74 
 
 		 349 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  63.77 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  63.48 
 
 		 351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  57.76 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  57.59 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  59.21 
 
 		 346 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  58.31 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  53.8 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  53.37 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  53.37 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  55 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  46.97 
 
 		 349 aa  278  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  44.92 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  45.03 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  43.97 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.97 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  43.68 
 
 		 350 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.88 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  43.03 
 
 		 343 aa  258  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  44.88 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  43.97 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  42.12 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  42.73 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  41.47 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  41.47 
 
 		 343 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  41.47 
 
 		 343 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  42.46 
 
 		 339 aa  245  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  41.34 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.85 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  43.67 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  41.44 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  41.64 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  41.99 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  43.07 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  43.03 
 
 		 350 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  40 
 
 		 352 aa  228  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  41.34 
 
 		 361 aa  225  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  39.29 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  39.12 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  36.09 
 
 		 336 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.54 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.01 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.95 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  31.46 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.19 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29.1 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.97 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.38 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  26.75 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.47 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  24.84 
 
 		 357 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  29.67 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  25.08 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  24.29 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.08 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  26.49 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  26.49 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.49 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  25.23 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  26.91 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.42 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  31.11 
 
 		 301 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  26.69 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.79 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.88 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25.16 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  24.24 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  30.1 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  23.94 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  26.3 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  25.51 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.99 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  28.71 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  28.88 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  27.66 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.14 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.51 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  24.51 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.75 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  27.6 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.61 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.49 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.47 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  30.2 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.29 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.59 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.39 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  26.15 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.06 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  30.16 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>