More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3088 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  100 
 
 		 299 aa  586  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  68.94 
 
 		 754 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  65.54 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  67.34 
 
 		 543 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  66.44 
 
 		 557 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  69.97 
 
 		 300 aa  377  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  63.76 
 
 		 299 aa  374  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  64.77 
 
 		 764 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  62.88 
 
 		 758 aa  360  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  62.42 
 
 		 753 aa  358  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  63.09 
 
 		 507 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  60.94 
 
 		 298 aa  345  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  58.05 
 
 		 531 aa  309  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  56.11 
 
 		 775 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  50.83 
 
 		 519 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  52.85 
 
 		 293 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  52.56 
 
 		 752 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  45.75 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.41 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3153  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.34 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0290174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8878  hypothetical protein  37.46 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6599  hypothetical protein  38.11 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.92 
 
 		 734 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  40.91 
 
 		 371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.45 
 
 		 726 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  34.88 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  34.69 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  45.18 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  39.33 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  34.98 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.33 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  35.83 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  43.37 
 
 		 391 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  43.37 
 
 		 391 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  33.48 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  36.79 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  32.32 
 
 		 338 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.07 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  39.88 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  42.77 
 
 		 391 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  29.08 
 
 		 330 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  28.72 
 
 		 330 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.09 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  25.9 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  38.38 
 
 		 389 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  32.73 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  39.46 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  31.68 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  34.24 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  37.72 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.39 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  34.22 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  28.2 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  30 
 
 		 338 aa  92.4  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  31.6 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  31.13 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  35.18 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  32.56 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.77 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  31.13 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.49 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  33.15 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  30.89 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  38.22 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  30.88 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  36.62 
 
 		 353 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.04 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  34.45 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  33.85 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  27.34 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.27 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  33.46 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  34.02 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  33.04 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  33.85 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  34.02 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  33.04 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  33.85 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  31.88 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  33.07 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.66 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  34.02 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  33.04 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  36.67 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  33.1 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  25.24 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.5 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  25.24 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  36.67 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  31.07 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  26.39 
 
 		 342 aa  86.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  29.63 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>