More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2713 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  100 
 
 
359 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  48.74 
 
 
343 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.83 
 
 
339 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  47.4 
 
 
339 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  45.83 
 
 
339 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  49.68 
 
 
344 aa  269  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  49.67 
 
 
341 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.8 
 
 
352 aa  262  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  46.32 
 
 
349 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  50.16 
 
 
346 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  48.04 
 
 
348 aa  252  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  46.25 
 
 
372 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  43.69 
 
 
346 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  43.12 
 
 
346 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  47.71 
 
 
361 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  45.56 
 
 
349 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  41.34 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  39.33 
 
 
344 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  42.47 
 
 
345 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  40.48 
 
 
352 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  45.48 
 
 
372 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  40.31 
 
 
347 aa  238  9e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  39.83 
 
 
343 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 
348 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  39.68 
 
 
343 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  41.88 
 
 
345 aa  236  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  39.68 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  41.16 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  39.68 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  41.95 
 
 
351 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  44.79 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  41.03 
 
 
344 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  44.17 
 
 
350 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  40.19 
 
 
345 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  43.4 
 
 
342 aa  230  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  41.35 
 
 
346 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  40.62 
 
 
349 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  40.62 
 
 
349 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  40.62 
 
 
349 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.83 
 
 
351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.82 
 
 
346 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  40.5 
 
 
354 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  37.54 
 
 
342 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  40.88 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.68 
 
 
361 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  41.21 
 
 
350 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  40.33 
 
 
349 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  40.33 
 
 
349 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  41.67 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.03 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34 
 
 
333 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.92 
 
 
332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.19 
 
 
327 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  34.16 
 
 
336 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  34.98 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.79 
 
 
334 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  31.88 
 
 
326 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.84 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  33 
 
 
341 aa  126  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 
318 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.88 
 
 
327 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  32.53 
 
 
346 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  29.77 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  30.6 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.42 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  31.46 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  32.07 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  27.91 
 
 
348 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  26.88 
 
 
360 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  29.66 
 
 
348 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  29.66 
 
 
353 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  31.06 
 
 
318 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  29.66 
 
 
353 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  30.74 
 
 
360 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  28.53 
 
 
337 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.94 
 
 
321 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  32.3 
 
 
330 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  31.08 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  34.5 
 
 
343 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  28.06 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  28.06 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.69 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.06 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.93 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  31.19 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  35.27 
 
 
309 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  27.16 
 
 
349 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  26.38 
 
 
349 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  27.3 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  33.45 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  30.72 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  30.07 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  30.07 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  30.07 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.42 
 
 
318 aa  90.1  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.47 
 
 
298 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  29.85 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  32.81 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  30.66 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  27 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>