More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4065 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  100 
 
 		 344 aa  688    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  68.82 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  36.09 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  35.47 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  35.78 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  36.31 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  36.31 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.31 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  31.4 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  31.97 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  30.67 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  32.29 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  32.77 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.76 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  27.8 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  30.72 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  30.72 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  30.72 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  33.97 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  34.08 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  32.58 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.35 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.88 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  35.47 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.18 
 
 		 352 aa  115  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.42 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.82 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  28.42 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  31.11 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  30.52 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  31.31 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  28.39 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  32.35 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  29.69 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.6 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  31.48 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  30.91 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  28.39 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  30.91 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  31.07 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  29.75 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  29.97 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  34.77 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.79 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  30.07 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.07 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  27.81 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  30.07 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  29.27 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  30.07 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  31.95 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  29.62 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  29.62 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  30.52 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.1 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.7 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.71 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  30.6 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  31.91 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  30.74 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  32.47 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  31.11 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  31.33 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.74 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  33.54 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  28.66 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  29.87 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.3 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  30.89 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.25 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  30.63 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  27.49 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  30.82 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  32.81 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  29.56 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  29.56 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  30.25 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  29.84 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.56 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  30.82 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4580  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  29.6 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  32.46 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.95 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.95 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  31.15 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.45 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.21 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.88 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>