185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4580 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4580  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  100 
 
 		 358 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  57.14 
 
 		 331 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  39.53 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  39.53 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.53 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  33.94 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  33.64 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  33.33 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  31.68 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  32.34 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  28.34 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  30.48 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  28.47 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  28.2 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  29.55 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  27.85 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  27.85 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  27.85 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  29.31 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  31.72 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 		 333 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  29.71 
 
 		 344 aa  96.3  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  31.42 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  23.46 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  30.25 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.62 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  27.46 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  30.42 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  30.42 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  28.46 
 
 		 327 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.52 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.81 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  28.71 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  26.17 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.47 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.49 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  27.94 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  29.2 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.43 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.59 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  30.9 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.65 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.23 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  27.24 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.37 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  27.76 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  27.53 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  27.65 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  29.24 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  25.61 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25.52 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  30.35 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.21 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  26.42 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  29.08 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  28.36 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  24.41 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.69 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  28.73 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  25.93 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  27.57 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  28.36 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  28.36 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.54 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  25 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  28.69 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.24 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  28.84 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.31 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  25.61 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  27.86 
 
 		 330 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.53 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  26.46 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  26.46 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  26.46 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  25.62 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  27.02 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  27.43 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  27.43 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  27.43 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.45 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.7 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3116  luciferase family protein  28.47 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878039  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  26.88 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  24.32 
 
 		 343 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.95 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.73 
 
 		 334 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  24.32 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.46 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  24.32 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 329 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  28.28 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>