More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2006 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  100 
 
 		 335 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  51.27 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  51.27 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  55.14 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  51.27 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  50.64 
 
 		 337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  51.27 
 
 		 340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  51.27 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  52.37 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  56.06 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  49.83 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  45.21 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  44.55 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  42.82 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  44.06 
 
 		 341 aa  281  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  46.35 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  46.03 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  46.03 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  45.48 
 
 		 349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  42.77 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  44.55 
 
 		 329 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  37.88 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  31.25 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  32.5 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  29.38 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  29.06 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  29.06 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  34.39 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  34.08 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  33.76 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  30.62 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  33.75 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  33.75 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.75 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.16 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  30 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29.51 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.39 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.34 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.57 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  28.09 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.09 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.37 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.74 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.03 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.33 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4580  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  30.48 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.57 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  25.96 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  29.37 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.37 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  29.37 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  28.04 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  30.47 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.04 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  27.5 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  30.88 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  26.67 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.79 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  29.33 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  27.15 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  25.75 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  27.2 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  26.49 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  26.25 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.16 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  30.69 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  27.48 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  27.14 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  23.7 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  27.14 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  30.6 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  24.35 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.59 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  28.44 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  27.64 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  25.93 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  27.88 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  25.89 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  25.89 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  24.25 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.21 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.14 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  26.06 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  25.67 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.81 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  26.03 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.64 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.18 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>